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海洋微生物ZD02信号降解酶基因aiiA克隆及其生物信息学分析

Cloning and bioinformatic analysis of signal-degrading enzyme gene aiiA from marine bacterium ZD02

摘要根据细菌群体感应信号降解酶(AiiA)基因设计简并引物,从海洋微生物ZD02基因组中扩增编码AiiA的基因aiiA,筛选其阳性克隆,测序后分析其基因序列.结果表明:筛选到的阳性克隆ZD02-aiiA序列全长753 bp(Genbank登录号:KC756214),存在一个开放阅读框(ORF),编码由250个氨基酸残基组成的多肽,预测分子量为28.1 kDa,蛋白等电点为4.78.由该序列推导得到的氨基酸残基序列含有一个保守结构域(Lactamase-B) (34AA~235AA),并预测了AiiA的三级结构.以上研究为该序列的重组表达及其相关活性研究奠定了基础.

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生态学杂志

生态学杂志

2013年32卷8期

2056-2061页

ISTICPKUCSCDCABP

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