首页 > 生态学杂志 > 刺参肠道及养殖环境菌群结构与功能

刺参肠道及养殖环境菌群结构与功能

Bacterial community structure and function in the intestinal tracts and culture environment of sea cucumber (Apostichopus japonicus)

摘要基于MiSeq高通量测序技术,分析了黄、渤海秋季池塘养殖刺参(Apostichopus japonicus)肠道及养殖环境菌落结构、α-多样性指数和菌群功能.结果表明:黄海和渤海养殖池塘底泥菌群Chao1指数、ACE的指数均较高,表明养殖池塘底泥菌群较为丰富;黄海和渤海养殖刺参肠道及养殖环境中优势菌门均为变形菌门(比例＞43.25％);两个海域中刺参肠道中优势菌属相同,均为Halioglobus(比例＞12.67％);养殖环境中的优势菌属则存在差异,黄海养殖水体的优势菌属为Roseibacillus(13.59％);渤海养殖水体优势菌属为海命菌属(Marivita)(21.33％);黄海养殖底泥样品DN-1和DN-2中优势菌属为Desulfopila(＞9.26％),DN-3中优势菌属为Halioglobus(3.67％);渤海养殖底泥中优势菌属为硫深海菌属(Thioprofundum)(3.79％);在渤海海域中还发现了特有菌属海命菌属(Marivita)、Ascidiaceihabitans、别弧菌属(Aliivibrio),且所占比例较大;黄海和渤海各样品中菌群经COG及KEGG数据库分析,共注释到24组COG功能分类,主要集中在氨基酸转运与代谢;41条KEGG信号通路,主要集中在氨基酸转运与代谢、碳水化合物代谢、膜转运.研究结果为合理进行刺参养殖、疾病防控提供了理论依据.