换一批嗜酸热原体菌的超氧化物歧化酶的结构模建和进化踪迹分析
Structure Modeling and Evolutionary Trace Analysis of Superoxide Dismutase from Extremophile Thermoplasma Acidophilum
摘要为考察来源于极端高温酸性环境中的超氧化物歧化酶,建立了一个由嗜酸热原体茵的sod基因编码的蛋白质的可靠三维分子结构,并对这个蛋白质进行进化踪迹分析识别出了11个踪迹残基?其中,残基Asn39,Gly105和Glu162的位置随机遍布整个结构,其余的残基却全部都明显地聚于一个靠近铁原子的子类当中?由此从在三维结构确认sod基因编码含铁的超氧化物歧化酶.此外,那些被识别的靠近铁原子的踪迹残基可能跟铁的绑定和催化功能直接相关?
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关键词
超氧化物歧化酶嗜酸热原体菌同源建模进化踪迹分析分子动力学Superoxide dismutase(SOD)Thermoplasma acidophilumHomology modelingEvolutionary traceMolecular dynamics
分类号
Q554+.9（酶）
栏目名称
DOI
10.3969/j.issn.1673-6273.2008.06.017
发布时间
2008-07-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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