换一批致心律失常性右心室心肌病致病蛋白的挖掘
Mining Arrhythmogenic Right Ventricular Cardiomyopathy Potential Disease Protein
摘要目的:鉴定疾病蛋白对深入理解致心律失常性右心室心肌病(ARVC)致病机制至关重要.可以采用计算生物学的方法,在ARVC疾病相关网络中挖掘新的潜在的致病蛋白.方法:本文整合HPRD和BioGRID的蛋白质互作数据,获得了较为全面且真实可靠的蛋白质互作数据；通过结合文本挖掘和统计学检验筛选出ARVC种子蛋白,应用最近邻居扩增的方法,构建ARVC蛋白质互作网络(PPIN),并采用PRINCESS法则对网络中每对互作蛋白加权；最后,基于ARVC关联得分策略对网络中的每个蛋白质打分并排秩.结果:分析发现排秩前50的候选蛋白大都与ARVC关系密切,如PRKCA,CDH1,SMAD4,SMAD2,CDH5,CTNNA1,DSC1等在调节心肌收缩、细胞程序性死亡、心脏的发育过程及维持桥粒的完整性方面起重要作用.结论:我们提出的方法为鉴定与ARVC致病机制相关的新致病蛋白提供了有效的途径.
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医学主题词
蛋白(Egg White)心律失常性右心室发育不良(Arrhythmogenic Right Ventricular Dysplasia)方法(Methods)疾病(Disease)性(Sex)
栏目名称
发布时间
2012-10-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
黑龙江省教育厅项目（12511271）
黑龙江省自然科学基金（D200834）
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