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蛋白质的二级结构预测研究进展

Advanced Studies on Protein Secondary Structure Prediction

摘要认识蛋白质的二级结构是了解蛋白质的折叠模式和三级结构的基础,并为研究蛋白质的功能以及它们之间的相互作用模式提供结构基础,同时还可以为新药研发提供帮助.故研究蛋白质的二级结构具有重要的意义.随着后基因组时代的到来,越来 越多的蛋白质序列不断被发现,给蛋白质的二级结构研究带来巨大的挑战和研究空间.而依靠传统的实验方法很难获取大规模蛋白质的二级结构信息.目前,采用生物信息学手段仍然是获得大部分蛋白质二级结构的途径.近年来,许多研究者通过构建用于二级结构预测的蛋白质数据集,计算、提取蛋白质的各种特征信息,并采用不同的预测算法预测蛋白质的二级结构得到了快速的发展.本文拟从蛋白质的特征信息的提取与筛选、预测算法以及预测效果的检验方法等方面进行综述,介绍蛋白质二级结构预测领域的研究进展.相信随着基因组学、蛋白质组学和生物信息学的不断发展,蛋白质二级结构预测会不断取得新突破.

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