换一批衰老相关分泌表型分子在肝内胆管癌发生发展中的作用探究
The Role of Senescence-associated Secretory Phenotype Molecules in Tumorigenesis and Progression of Intrahepatic Cholangiocarcinoma
摘要目的:探究衰老相关分泌表型(senescence-associated secretory phenotype,SASP)分子在肝内胆管癌发生发展中的作用.方法:利用蛋白质组数据进行肝内胆管癌分子分型并进行亚型间生存分析,对肿瘤相对于癌旁及其不同亚型之间的SASP差异蛋白进行GO(Gene ontology)功能富集分析;利用转录组数据通过ESTIMATE、xCell、TIDE评分对肿瘤不同亚型进行免疫浸润分析及免疫治疗反应预测;搜集整合驱动基因相关数据库,并与SASP差异蛋白进行交叠比较;采用Pearson相关系数筛选与SASP差异蛋白相关的lncRNA.结果:将116例肿瘤样本划分为3个亚型,生存曲线提示S3亚型预后较差,生存时间更短.S3亚型肿瘤纯度低,免疫细胞、基质细胞含量高但对免疫治疗的反应较差,存在细胞毒性T细胞功能失调、T细胞排斥.肿瘤相对于癌旁上调的SASP差异蛋白倾向于参与染色体区域的核酸代谢、对外界刺激的反应,下调的SASP蛋白倾向于参与线粒体区域的脂质代谢等过程.共筛选到5个SASP相关驱动基因,其中INSR、PIK3CA是S3恶性亚型特有的.共得到4个与肝内胆管癌SASP差异蛋白相关的lncRNA分子,生存曲线提示INAFM2为危险因素.结论:肝内胆管癌的SASP相关差异蛋白在肿瘤发生过程中倾向于在染色体区域发挥核酸代谢作用,在向恶性亚型转化的过程中倾向于在线粒体区域发挥脂质代谢调节及蛋白磷酸化作用.INAFM2有望成为肝内胆管癌诊断和治疗的新靶点.
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关键词
衰老相关分泌表型肝内胆管癌生物信息学驱动基因长链非编码RNASenescence-associated secretory phenotypeIntrahepatic cholangiocarcinomaBioinformaticsDriver geneLong non-coding RNA
栏目名称
DOI
10.13241/j.cnki.pmb.2025.05.001
发布时间
2025-04-02（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
国家自然科学基金（32270711）
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