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基于RNA测序研究愈疡汤对人胃黏膜上皮细胞基因表达的影响及临床意义

Study on the Mechanism of the Traditional Chinese Medicine Compound YuYang Decoction in Affecting the Gene Expression Profile of Gastric Mucosal Epithelial Cells and its Potential Clinical Value

摘要目的:采用RNA测序技术,从基因和分子层面观察愈疡汤对人胃黏膜上皮细胞(GES-1)基因表达谱的影响.方法:以GES-1为对象,采用CCK-8法检测不同剂量及时间愈疡汤对GES-1细胞增殖活性的影响.采用RNA测序检测愈疡汤作用后GES-1细胞基因表达的变化,筛选差异表达基因.对差异表达前5位的基因进行GO富集分析和KEGG通路富集分析.我们对SCF、p21差异表达的基因进行了观察,利用Western blot法完成蛋白表达验证.在体内试验,免疫荧光和免疫共沉淀法观察了萎缩性胃炎患者胃黏膜细胞中SCF、p21差异蛋白的表达,发现二者可能与临床病理因素具有潜在的相关性.结果:愈疡汤80 μg/mL,作用24小时后,GES-1细胞中共有差异表达基因312条,其中233条基因表达上调,79条基因下调.上、下调表达差异前5位的基因分别为 CYP1A1、IL24、IKBKGP1、GDF15、SCUBE1,和 OASL、ADAMTS5、SULF1、ID2、DDX60.主要与促进伤口愈合、细胞增殖和迁移、免疫和炎症等有关.GES-1细胞中的差异表达基因主要分布于胞外区域,富集于细胞因子的产生及反应、刺激反应等生物学过程,发挥增殖因子受体活性等分子功能.KEGG富集分析显示为多个信号通路.结论:经愈疡汤处理后,GES-1细胞共有312条基因表达差异明显,且以表达上调为主.表达差异基因可能通过多条信号通路参与机体基于细胞增殖的再生和修复.愈疡汤调控SCF与p21蛋白的表达,可能与临床病理因素具有潜在相关性.

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