换一批
换一批太湖地区典型菜地土壤微生物16S rDNA的PCR-RFLP分析
PCR-RFLP analysis of bacterial 16S rDNA from a typical garden soil in Taihu region
摘要土壤微生物多样性是土壤生态功能的基础,但长期以来缺乏对高强度土地利用条件下的土壤微生物多样性的认识.作者采用间接法提取了江苏省太湖地区典型菜地土壤微生物的总DNA,以细菌的通用引物27F和1492R扩增16S rDNA片段,将扩增产物与T-载体酶连,转化大肠杆菌,建立土壤微生物16S rDNA克隆文库.PCR扩增基因文库中插入的16S rDNA外源片段,用两种限制性内切酶Hha I和Rsa I分别酶切,获得该土壤173个克隆的酶切指纹图谱.结果表明,Hha I和Rsa I联合酶切产生了63个基因分型,文库的覆盖度达76.30%,单一酶切产生的基因分型少,但文库的覆盖度高;克隆文库中存在两种优势类群,分别占总克隆的16%和12%.16S rDNA测序结果表明,太湖地区菜地土壤细菌在分类方面主要属于α-和γ-变形杆菌亚门.以上结果为进一步研究太湖地区菜地土壤微生物生态功能提供了基础资料.
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分类号
Q94
栏目名称
研究报告
DOI
10.3321/j.issn:1005-0094.2006.04.010
发布时间
2006-08-14
基金项目
国家自然科学基金
中国科学院知识创新工程项目
中国博士后科学基金
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