换一批
换一批基于三代测序技术的微生物组学研究进展
Analysis of prospective microbiology research using third-generation sequencing technology
摘要微生物在人类生活中无处不在,过去人们对微生物的认识仅停留在单菌培养和定性研究上,而测序技术的发展极大地促进了微生物组学的研究.越来越多的证据表明:人体共生微生物、特别是肠道微生物与人类健康息息相关.二代测序技术凭借其高通量、高准确率和低成本的特点,成为微生物组学研究中的主流测序技术.但是随着研究的深入,二代测序技术的短读长(＜ 450 bp)增加了后续数据分析和基因组拼接难度,也限制了该技术在未来研究中的应用.在此背景下,第三代测序技术应运而生.第三代测序技术又称单分子测序,能够直接对单个DNA分子进行实时测序,而不需要经过PCR扩增.第三代测序技术的平均读长在2-10 kb左右,最高可以达到2.2Mb,实现了长序列的高通量测序.凭借其超长的测序读长、无GC偏好性等优势,三代测序技术为微生物基因组全长测序,组装完整可靠的基因组提供了新的方法.本文在描述三代测序的技术特点和原理的基础上,重点介绍了三代测序技术在微生物16S/18S rRNA基因测序、单菌的基因组组装以及宏基因组中的研究应用和进展.
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栏目名称
综述
DOI
10.17520/biods.2018201
发布时间
2019-07-11
基金项目
科技部重点研发子课题
国家自然科学基金
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