东乡野生稻可培养内生细菌群落组成及多样性

Community composition and diversity of cultivable endophytic bacteria isolated from Dongxiang wild rice

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摘要内生细菌对宿主植物生长发育和生理代谢具有重要影响,揭示其群落组成和多样性具有重要的生物学和生态学意义.本研究采用可培养法从东乡野生稻(Oryza rufipogon)不同组织中分离获得94株内生细菌,基于16S rRNA基因序列比对和系统发育分析将其归属于变形菌门、放线菌门和厚壁菌门3门14科17属,其中芽孢杆菌属(Bacillus)和微小菌属(Microbacterium)为优势属,分别占总株数的27.7％和20.2％.不同组织中内生细菌的分布和多样性存在差异,根中内生细菌数量最多(34株,36.2％),叶次之(32株,34.0％),茎最少(28株,29.8％);根中内生细菌Shannon-Wiener多样性指数(H'=2.52)、Simpson优势度指数(D=0.88)和Pielou均匀度指数(E=0.72)均高于茎与叶,根和茎的Jaccard相似性系数(C=0.29)低于根和叶(C=0.47)以及茎和叶(C=0.45).研究结果表明,东乡野生稻内生细菌具有丰富的物种多样性,并且不同组织部位的内生细菌组成存在差异,根中内生细菌多样性最丰富.