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免疫共沉淀结合基因芯片对m3G帽子结构RNA的分离鉴定

Determination of the Structure of m3 G Cap RNA by Co-immunoprecipitation and Microarray

摘要目的:通过免疫共沉淀和基因芯片技术,建立一种RNA 5’端帽子结构的鉴定方法.方法:利用m3G帽子结构的特异性抗体对线虫的总RNA进行免疫共沉淀,为线虫127个非编码RNA设计探针,制备了检测基因芯片,对其帽子结构进行鉴定,并对RNA的转录进行分析.结果:37个非编码RNA被分离鉴定为含有m3G帽子结构,与其它物种已发现m3G帽子的RNA比较,结果基本一致.结论:免疫共沉淀结合基因芯片技术对非编码RNA 5’端帽子结构分离鉴定的方法是可行有效的.此方法特异性强,灵敏度高,对大规模RNA帽子结构的鉴定、新RNA的发现和RNA功能的鉴定都具有一定的参考和应用价值.

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分类号 Q522Q74
栏目名称 技术与方法
DOI 10.13523/j.cb.20140211
发布时间 2014-04-01
基金项目
高等学校博士学科点专项科研基金 感谢山西农业大学科技创新基金项目(2008027)的资助,感谢美国密歇根大学Springmann J 博士对文章语言部分的修改
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中国生物工程杂志

中国生物工程杂志

2014年34卷2期

65-70页

ISTICPKUCSCDCA

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