换一批利用语义网技术实现的分布式异构食品微生物数据整合
Integrating Distributed Heterogeneous Food Microorganism Data by Semantic Web Technology
摘要随着高通量测序技术的迅速发展和食品微生物研究的逐步深入,产生了大量的数据和知识,且以不同的数据格式分布在各种数据库中.为了更好地支持食品微生物的相关研究,从各种分布式、异构的数据和知识中,进行数据提取与转换,并形成一个整合的数据平台显得尤为重要.FoodMicrobes数据库利用语义网技术,建立了一个食品微生物的整合型数据平台.该平台从各种开放的公共数据库,提取了与食品微生物相关的基因、基因组、基因功能、蛋白质序列与结构、代谢途径、文献、专利等信息,利用RDF的方法,对数据进行转换,并建立了数据之间的关联,实现了数据整合,是目前在食品微生物领域以语义网方式建立的第一个数据库.在该平台中,实现了将食品微生物的物种、菌株层面的宏观信息与基因组、蛋白质、代谢与功能等微观层面信息的贯通,并通过友好的数据检索界面,为用户进行食品微生物研究提供了重要的工具.
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分类号
Q811.4（生物工程学仿生学）
栏目名称
DOI
10.13523/j.cb.20170317
发布时间
2017-05-04（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
国家自然科学基金（31271922）
国家高技术研究发展计划（863计划）（863;2012AA021301,2014AA021501,2013AA102106）
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