换一批大肠杆菌噬菌体phiE31-2生物学特性及基因组分析
Biological Characteristics and Genomic Analysis of Escherichia coli Phage phiE31-2
摘要目的:禽类养殖过程中抗菌素的广泛应用导致了耐药菌株的出现,噬菌体疗法能够裂解耐药菌株,具有替代抗菌素的潜力;从鸭粪便标本中分离鉴定大肠杆菌噬菌体phiE31-2,探究其在禽类养殖过程中应用的可能性.方法:通过麦康凯培养基分离大肠杆菌,利用双层平板法分离鉴定噬菌体,利用微量肉汤稀释法分析大肠杆菌耐药性,对噬菌体基因组进行测序及分析,通过无菌牛奶评估噬菌体的杀菌效率.结果:从鹅粪样品中分离大肠杆菌EK31-2,该菌对三种抗菌素耐受;以菌株EK31-2为指示菌,从鸭粪样品中分离噬菌体phiE31-2;稳定性分析发现,phiE31-2在pH值5.0～10.0范围内存活率高于77.67％,在400 μg/mL胆酸钠溶液中存活率为52.8％;基因组分析显示,phiE31-2基因组长度为51 468 bp,含有82个编码序列(coding DNA sequence,CDS)区域,其中35个蛋白具有假定功能;比较基因组学分析发现,噬菌体phiE31-2属于Tempevirinae亚科Hanrivervirus属的未确定成员;在生物控制实验中,phiE31-2可以杀死牛奶中86.8％的大肠杆菌EK31-2.结论:从鸭粪中分离的大肠杆菌噬菌体phiE31-2能够有效抑制耐药菌株EK31-2的生长,并且对酸碱环境变化和胆酸盐具有较好的耐受性,显示噬菌体phiE31-2具有在禽类养殖中应用的可能性.
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关键词
大肠杆菌耐药性噬菌体基因组功能注释比较基因组学生物防控Escherichia coliDrug resistancePhagePhage annotationComparative genomicsBiocontrol assay
栏目名称
DOI
10.13523/j.cb.2410026
发布时间
2025-06-05（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
国家自然科学基金（31970150）
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