换一批摘要转录本组装是基于第二代测序技术研究转录组的关键环节,其质量好坏直接影响到下游结果的可靠性,也是目前的研究热点与难点.转录本组装方法可以分为Genome-guided和de novo两类,它们在理论基础与算法实现方面各有优劣.转录本组装质量的高低依赖于PCR扩增错误率、第二代测序技术准确率、组装算法和参考基因组完整性等方面,而现有的算法还无法完全处理由这些因素带来的影响.本文从转录本组装方法与软件、影响组装质量的因素和对组装质量的评价指标等方面进行讨论,以期能指导纯生物学家对分析软件的选择.
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栏目名称
DOI
10.13345/j.cjb.140508
发布时间
2015-11-03（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
National Natural Science Foundation of China （(No.31172197)）
国家自然科学基金（(No.31172197)）
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