水稻蒸煮品质相关QTL定位及候选基因分析
Mapping of QTL associated with rice cooking quality and candidate gene analysis
摘要挖掘与稻米蒸煮品质相关的数量性状基因座(quantitative trait locus,QTL),分析候选基因,并通过遗传育种手段改良稻米蒸煮品质相关性状,可有效提升稻米的口感.以籼稻华占(Huazhan,HZ)、粳稻热研 2 号(Nekken2)及由其构建的 120 个重组自交系(recombinant inbred lines,RILs)群体为实验材料,测定成熟期稻米的糊化温度(gelatinization temperature,GT)、胶稠度(gel consistency,GC)和直链淀粉含量(amylose content,AC).结合高密度分子遗传图谱进行QTL定位,共检测到 26个与稻米蒸煮品质相关的QTLs(糊化温度相关位点 1 个、胶稠度相关位点 13 个、直链淀粉含量相关位点 12 个),其中最高奇数的可能性(likelihood of odd,LOD)值达 30.24.通过实时荧光定量PCR(quantitative real-time polymerase chain reaction,qRT-PCR)分析定位区间内候选基因的表达量,发现6 个基因在双亲间的表达量差异显著,推测LOC_Os04g20270和LOC_Os11g40100的高表达可能会极大地提高稻米的胶稠度,而LOC_Os01g04920和LOC_Os02g17500的高表达以及LOC_Os03g02650和LOC_Os05g25840的低表达有助于降低直链淀粉含量.这些结果为培育优质水稻新品种奠定了分子基础,并为揭示稻米蒸煮品质的分子调控机制提供了重要的遗传资源.
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