香蕉ADA1家族成员鉴定及其在生物和非生物胁迫下的表达分析
Identification of banana ADA1 gene family members and their expression profiles under biotic and abiotic stresses
摘要Spt-Ada-Gcn5-乙酰转移酶(Spt-Ada-Gcn5-acetyltransferase,SAGA)是高度保守的辅助转录起始复合物,转录接头蛋白-激活的改变/缺失亚基 1(alteration/deficiency in activation 1,ADA1),也称作组蛋白 H2A 功能互作因子 1(histone H2A functional interactor 1,HFI1),它是SAGA 核心模块中的一个亚基,在植物的生长发育和抗逆性方面发挥着重要的作用.为了解香蕉ADA1的分子特性,本研究基于香蕉基因组数据库,对香蕉ADA1基因家族成员进行鉴定,分析其基本理化性质、系统进化、选择压力、启动子顺式作用元件及生物与非生物胁迫下的表达等.结果显示,香蕉A、B及阿宽蕉基因组中分别有 10、6、7 个ADA1家族成员;成员均为不稳定的亲水性蛋白,均保守地含有SAGA-Tad1 结构域,MaADA1 和MbADA1 均可与SAGA核心模块中的SAGA相关因子 11(SAGA-associated factor 11,Sgf11)互作;系统发育显示香蕉ADA1基因家族成员可划分为 3 个亚族,进化过程中大多受纯化选择;香蕉ADA1基因家族成员的基因结构差异性较大;香蕉 ADA1 基因家族成员含有多个响应激素的作用元件;MaADA1-1 可能对香蕉在低温胁迫下的抗性起着重要的作用,MaADA1 均响应香蕉枯萎病菌胁迫.本研究表明,ADA1 基因家族成员在香蕉中高度保守,并可能响应生物与非生物胁迫.
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