换一批摘要本研究通过高通量测序技术对越南金花茶(Camellia insularis Orel&Curry)的叶绿体(chloroplast,cp)基因组进行了测序.结果显示,越南金花茶叶绿体基因组长度为 156 882 bp,包含132个基因,其中,88个编码蛋白质,36个编码tRNA,8个编码rRNA.密码子偏好性分析显示,编码亮氨酸的密码子数量最多,且第三位密码子显示出了较高的A/U偏好.此外,共鉴定出了67个简单重复序列(simple sequence repeats,SSR),发现越南金花茶SSR偏好使用A和T碱基.除了少数可变区域之外,越南金花茶与其近缘物种的叶绿体基因组反向重复(inverted repeat,IR)边界区域相当保守.系统发育分析表明,越南金花茶与云南金花茶(Camellia fascicularis)亲缘关系最近.金花茶是基因工程培育黄色山茶花的重要材料,本研究为叶绿体工程提供了基本的遗传信息,为深入研究金花茶组植物的进化、物种鉴定和基因组育种研究提供了宝贵的资源.
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关键词
越南金花茶叶绿体基因组结构特征系统发育分析Camellia insularis Orel&Currychloroplast genomestructural characteristicphylogenetic analysis
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DOI
10.13345/j.cjb.230160
发布时间
2024-11-18（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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