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类球红细菌基因组密码子偏好性分析

Analysis of Codon Usage Bias in the Genome of Rhodobacter sphaeroides

摘要密码子偏好性可影响外源基因在其体内的表达,为了解类球红细菌的密码子使用模式,本研究利用CodonW对类球红细菌 2.4.1的基因组进行分析.结果显示,类球红细菌密码子的使用偏好性主要受选择压力的影响,在类球红细菌使用频率较高的 27 个密码子中,其中GC结尾的密码子占85.19%.同时确定了15 个高表达优越密码子,除终止密码子外,其余都以GC结尾,表明类球红细菌中的密码子使用偏向于GC结尾的同义密码子.类球红细菌与大肠杆菌和谷氨酸棒状杆菌的密码子在使用偏好性上差别较小,与酿酒酵母的差异相对较大.本研究对开发类球红细菌基因表达宿主以及提高外源基因在类球红细菌中的表达提供理论基础.

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