换一批抑制启动子的三链DNA的结构模建及稳定性研究
Stability and Molecular Modeling of Triplex DNA Inhibiting DNA Binding Protein Binding to the Core Promoter of Hepatitis B Virus
摘要在IRIS Indigo2(SGI公司)工作站上,利用InsightⅡ/MSI软件包,以TAT三链DNA为模板,采用同源模建的方法,分别建立起两个含21nt的脱氧寡核苷酸CP1(G3TG2TGT2G5TG2TGT)和CP3(TGTG2TG5T2GTG2TG3)的三维结构.采用分子力学方法进行能量优化,将得到的能量最低结构作为分子的优势构象.研究结果显示,CP1的能量低于CP3的能量,即前者的结构较后者稳定.从而证明了CP1与乙肝病毒(HBV)的核心启动子(Cp)片段之间能稳定地形成三链DNA,并能特异性地抑制DNA结合蛋白与Cp片段的结合.这些结果表明,三链DNA的形成有可能抑制DNA的转录.
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分类号
Q71（生物大分子的结构和功能）
栏目名称
DOI
10.3321/j.issn:1000-3282.2000.03.016
发布时间
2004-01-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
中国科学院项目（非规范项目）（39770418）
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