换一批摘要在基因组测序工作完成后,利用计算工具进行基因识别以及基因结构预测受到了越来越多人的重视.人们开发了大量的相关应用软件,如GenScan, Genemark, GRAIL等,这些软件在寻找新基因方面提供了很重要的线索.但基因的识别和预测问题仍未得到完全解决,当目标基因的编码序列有缺失和插入时,其预测结果和基因的实际结构相差很大.为了消除测序错误对预测结果的影响,希望能找出编码序列区的测序错误.基于这种想法,尝试根据DNA序列的一些统计特性,利用隐马尔科夫模型(Hidden Markov Model),引入缺失和插入状态,然后用Viterbi算法,从中找出含有缺失和插入的外显子序列片段.在常用的Burset/Guigo检测集进行检测,得到的结果在外显子水平上,Sn(sensitivity)和Sp(specificity)均达到84%以上.
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分类号
Q612（理论生物物理学）
栏目名称
DOI
10.3321/j.issn:1000-3282.2002.01.014
发布时间
2004-01-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
国家自然科学基金（19971005）
:高等学校博士学科点专项科研基金
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