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不具有3-碱基周期性的编码序列初探

Tentative Study of the Coding Sequences Without 3-base Periodicity

摘要对12 0个较短编码序列(<1 200 bp)的Fourier频谱进行分析表明,3-碱基周期性在短编码序列中并不是绝对存在的.统计分析提示,编码序列有无3-碱基周期性与序列的碱基组成和分布、所编码蛋白质氨基酸的选用和顺序以及同义密码子的使用都有一定的关系.一般地,非周期-3序列中A+U含量高于G+C含量,周期-3序列的情况则相反;非周期-3序列中碱基在密码子三个位点上的分布比周期-3序列中的分布均匀;非周期-3序列密码子和氨基酸的使用偏向没有周期-3序列的大.在利用Fourier分析方法预测DNA序列中的基因和外显子时,应充分考虑到这些现象.

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分类号 Q617
栏目名称 研究报告
DOI 10.3321/j.issn:1000-3282.2002.02.021
发布时间 2004-01-08
基金项目
教育部科学技术研究项目
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生物化学与生物物理进展

生物化学与生物物理进展

2002年29卷2期

267-272页

SCIISTICPKUCSCDCABP

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