换一批摘要MicroRNAs(miRNAs)是动植物中较短的参与调控基因表达的功能性非编码RNA序列.第一个miRNA是通过实验手段发现的,然而通过实验手段识别miRNA在技术上仍然具有很大的挑战性和不完整性.因此,miRNA基因识别需要寻求计算方法来弥补实验方法的不足.提出了一个全新的miRNA前体的识别方法.在构造识别模型中,把初级序列和序列二级结构相结合,采用k-gram方法把序列信息映射到高维特征空间中,然后通过特征选取方法提取特征,并用这些特征为miRNA前体的识别构造了基于SVM的识别模型.同时,采用隐马尔可夫模型(HMM)的学习方法进行了比较.实验结果表明,该方法是有效的,可以达到较高的敏感性和特异性.
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分类号
R3（基础医学）
栏目名称
DOI
10.3321/j.issn:1000-3282.2007.02.006
发布时间
2007-03-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
国家自然科学基金（30570425）
国家重点基础研究发展计划（973计划）（2003CB715903）
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