换一批采用蛋白质组学技术筛选鼻咽癌细胞的甲基化沉默基因
Identification of Hypermethylated Genes in Nasopharyngeal Carcinoma Cell Line by Proteomics
摘要为筛选鼻咽癌的甲基化沉默基因,采用二维凝胶电泳(2-DE)技术分离甲基转移酶抑制剂5-杂氮-2'-脱氧胞苷(5-aza-2-dC)处理与未处理鼻咽癌细胞5-8F的蛋白质,PDquest图像分析软件识别差异蛋白质点,基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)鉴定差异蛋白质.然后采用Western blotting和RT-PCR检测差异蛋白质nm23-H1在药物处理与未处理5.8F细胞中的表达水平,采用甲基化特异性PCR(MS-PCR)检测nm23-H1基因在药物处理与未处理5-8F细胞中的甲基化水平.建立了5-aza-2-dC处理与未处理5.8F细胞蛋白质的2-DE图谱,识别了49个差异表达的蛋白质点,鉴定了33个差异表达的蛋白质,其中包括rim23.H1在内的15个蛋白质在5-aza-2-dC处理后的5-8F细胞中表达上调,而18个蛋白质表达下调.Western blotting和RT-PCR结果显示,nm23-H1在5-aza-2-dC处理5-8F细胞后表达上调,MS-PCR结果显示,在5-aza-2-dC处理5-8F细胞后nm23-H1基因甲基化水平下降,结果证实,nm23-H1基因是5-8F细胞中的甲基化沉默基因.15个5-aza.2-dC处理后表达上调的基因可能是5-8F细胞中的甲基化沉默基因,为筛选鼻咽癌甲基化失活基因提供了科学依据.
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分类号
R318.0（医用一般科学）
栏目名称
DOI
10.3321/j.issn:1000-3282.2008.04.008
发布时间
2008-07-14（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
国家重点基础研究发展计划(973)（(2001CB5120)）
芙蓉学者特聘教授科研奖励基金（(湘教通[2007]362号)）
教育部跨世纪优秀人才培养计划基金（(教计函[2002]48)）
湖南省科技厅重大科技专项（(06SK2004)）
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