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首页 > 生物化学与生物物理进展 > 一种从多表达谱数据挖掘基因共表达团的新方法

一种从多表达谱数据挖掘基因共表达团的新方法

A Method to Detect Gene Co-expression Clusters From Multiple Microarrays

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摘要随着近年来高通量基因表达谱数据的涌现,集成多个不同实验条件的表达谱数据,并挖掘在多数据源都保守的基因共表达团,成为预测基因功能或者调控关系的方法之一.但是,常用的方法通常仅简单地集成不同表达谱数据并推导保守基因共表达团,这样可能会导致结果中出现并非真正在多数据源保守的共表达团.提出一种结合最小哈希与局部敏感哈希的新方法,可以高效地寻找在多表达谱数据源中真正保守的基因共表达团.结果分析证明,相比过去的方法,现提出的方法可以获得更加功能相关和调控相关的基因共表达团.

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作者 陈兰 [1] 王世敏 [1] 陈润生 [2] 学术成果认领
作者单位 中国科学院计算技术研究所,北京,100190;中国科学院研究生院,北京,100049 [1] 中国科学院计算技术研究所,北京,100190;中国科学院生物物理研究所,北京,100101 [2]
关键词 表达谱共表达网络最小哈希局部敏感哈希
医学主题词 基因(Genes)数据挖掘(Data Mining)方法(Methods)基因表达谱(Gene Expression Profiling)预测(Forecasting)
分类号 Q5（生物化学）
栏目名称
研究报告
DOI 10.3321/j.issn:1000-3282.2008.08.009
发布时间 2008-10-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
国家自然科学基金（30630040） 国家自然科学基金（30570393） 国家自然科学基金（30600729）
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生物化学与生物物理进展

生物化学与生物物理进展

2008年35卷8期

914-920页

SCIISTICPKUCSCDCABP

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