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新一代高通量RNA测序数据的处理与分析

A Review on The Processing and Analysis of Next-generation RNA-seq Data

摘要随着新一代高通量DNA测序技术的快速发展,RNA测序(RNA-seq)已成为基因表达和转录组分析新的重要手段.RNA-seq技术产生的海量数据为生物信息学带来了新的机遇和挑战.有效地对测序数据进行针对性的生物信息学处理和分析,成为RNA-seq技术能否在科学探索中发挥重大作用的关键.以新一代Illumina/Solexa测序平台所产生的数据为例,在扼要介绍高通量RNA-seq测序流程的基础上,对RNA-seq数据处理和分析的方法和现有软件做一个较为全面的综述,并对其中有待进一步研究的问题进行展望.

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作者 王曦 [1] 汪小我 [1] 王立坤 [2] 冯智星 [1] 张学工 [1] 学术成果认领
作者单位 生物信息学教育部重点实验室,清华信息科学与技术国家实验室(筹)生物信息学研究部,清华大学自动化系,北京100084 [1] 生物信息学教育部重点实验室,清华信息科学与技术国家实验室(筹)生物信息学研究部,清华大学自动化系,北京100084;吉林大学计算机科学与技术学院,长春130012 [2]
分类号 Q5Q6Q7
DOI 10.3724/SP.J.1206.2009.00151
发布时间 2010-10-18(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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生物化学与生物物理进展

生物化学与生物物理进展

2010年37卷8期

834-846页

SCIISTICPKUCSCDCABP

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