高通量RNA甲基化测序数据处理与分析研究进展
Recent Progress and Challenges in High Throughput RNA Methylation Sequencing Data Analysis
摘要随着高通量测序技术快速发展,MeRIP-seq (methylated RNA immunoprecipitation sequencing)测序技术开启了RNA表观遗传学研究新局面,能够在全基因组范围内描述RNA甲基化.从MeRIP-seq高通量数据中挖掘RNA甲基化模式,有助于揭示mRNA甲基化在调控基因表达、剪切等方面所发挥的潜在功能,有效指导癌症的干预治疗.本文从MeRIP-seq测序原理出发,较全面地综述MeRIP-seq数据处理和分析方法研究现状,并对其所面临的计算问题进行讨论和展望.
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