酿酒酵母中尿嘧啶基因表达的转录组分析及促生长差异基因挖掘
Transcriptome analysis for the expression of uracil in Saccharomyces cerevisiae and mining of growth-related differential genes
摘要细胞密度是微生物发酵中影响产量的重要因素之一,在酿酒酵母发酵过程中,向酵母浸出粉胨葡萄糖琼脂培养基(YPD)中额外添加尿嘧啶等组分会促进菌株生长.研究发现,表达尿嘧啶合成基因的酿酒酵母ZL2与未表达的对照菌株ZL1相比,在YPD中培养时亦表现出了生长优势.为探究尿嘧啶造成生长优势的原因,挖掘可能的促生长相关基因,对菌株ZL1和ZL2进行转录组测序.转录组分析结果表明,显著上调基因有256个,显著下调基因有634个;对显著的差异基因进行基因本体论(GO)富集分析和KEGG富集分析,探究差异基因的功能和参与的代谢通路,从差异基因中筛选出可能与细胞生长相关的4个上调基因和4个下调基因并在ZL1菌株中验证.结果表明,8个基因都明显促进了细胞生长,同时显著增加了工程菌株中麦角固醇和β-香树脂醇的产量.这为生物合成中细胞生物量的增加和微生物细胞合成天然产物的能力增强提供了借鉴.
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