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山羊痘病毒P32基因序列分析及其B细胞表位预测

Analysis of Genome Sequence of Goat Pox Virus P32 and Its Prediction of Related B Cell Epitopes

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摘要目的:比较山羊痘病毒不同分离株间P32基因的同源性,并对其B细胞表位进行预测.方法:选取GenBank上10株不同山羊痘毒株P32基因序列,采用DNAsis MAX序列分析软件对该基因序列进行同源性分析,并以B细胞表位分析参数及蛋白质二级结构分析数据,综合预测P32蛋白B细胞表位.结果:10株不同山羊痘毒株P32基因核苷酸及氨基酸序列同源性分别为99.4%和98.4%;在P32蛋白的肽链中,19～60、64～80、98～118、138～182和214～275区段亲水性强,17～45、64～75、88～97、110～128、152～165和201～251区段柔韧性好,150～172、200～255区段抗原指数高,而31～59、101～119、142～145、165～172和215～252区段表面可及性高,42～56、159～181、200～208和227～259区段.结论:不同山羊痘病毒株间P32基因具有较高的同源性,P32蛋白227～251区段可能是B细胞表位优势区,为P32蛋白功能的深入研究与新型疫苗的设计提供一定的基础.