首页 > 生物技术 > 黑曲霉木聚糖酶Xyn43A基因的克隆和生物信息学分析

黑曲霉木聚糖酶Xyn43A基因的克隆和生物信息学分析

Cloning and bioinformatics analysis of Xyn43A gene from Aspergillus niger

导出 LinkOut 学术成果认领

摘要[目的]克隆黑曲霉木聚糖酶(Xyn43A)基因,进一步对其进行生物信息学分析.[方法]利用3 'RACE与5'RACE技术,克隆Xyn43A全长cDNA序列,扩增Xyn43A的DNA序列,并进行序列分析.[结果]cDNA全长1 152bp(不含Poly(A)),包含一个957bp开放阅读框,编码信号肽19个氨基酸,成熟肽299个氨基酸,5'与3'非编码区分别为113bp、82bp.预测该蛋白相对分子量为33.47kDa,等电点为4.55.该序列含一个长度为86bp的内含子.Xyn43A为亲水性稳定蛋白,有4个N-糖基化位点,26个磷酸化位点.与GH43族木聚糖酶亲缘性较近,具有GH43族糖基水解酶典型的5叶片螺旋桨结构.[结论]克隆了一个新的木聚糖酶基因,属于GH43族糖基水解酶.

作者周晨妍 ^[1] 王燕 ^[1] 朱新术 ^[1] 刘振华 ^[1] 李同彪 ^[1] 学术成果认领

作者单位新乡医学院生命科学技术学院,河南新乡,453003 ^[1]

关键词黑曲霉木聚糖酶基因克隆生物信息学分析

医学主题词基因(Genes)计算生物学(Computational Biology)蛋白(Egg White)性(Sex)目的(Goals)

分类号 Q814（酶工程）

栏目名称

论著

DOI 10.16519/j.cnki.1004-311x.2015.03.045

发布时间 2015-07-31（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

基金项目

河南省教育厅科学技术研究重点项目（(“黑曲霉XZ-3S木聚糖酶基因克隆及工程菌的选育”.No.13A180861)）河南省高等学校青年骨干教师资助计划项目（(“黑曲霉XZ-3S所产木聚糖酶基因工程菌的选育及其发酵工艺研究”.No.2011GGJS-125)）新乡医学院科研项目培育基金（(“提高黑曲霉XZ-3S木聚糖酶热稳定性的定向分子改造研究”.No.2013ZD113)）