海岛棉WOX9基因(GbWOX9)的克隆及表达模式分析
Cloning and expression pattern analysis of WOX9 gene from Gossypium barbadense L.(GbWOX9)
摘要[目的] WOX9基因在植物的胚胎发育过程中发挥一定作用.[方法]根据已公布的雷蒙德氏棉WOX9基因序列的CDS设计一对引物,从海岛棉‘新海16’中克隆一个同源基因GbWOX9.通过实时荧光定量分析其在棉花体细胞胚不同阶段的表达模式.[结果]获得了1 038 bp的GbWOX9基因的开放阅读框(ORF),编码345个氨基酸,预测蛋白分子量约为38 264.54 kDa,等电点为6.7.通过结构域分析,发现GbWOX9中含有一个由65个氨基酸组成的保守同源异型结构域.系统进化树分析结果表明GbWOX9与亚洲棉GaWOX9亲缘关系较近.亚细胞定位预测该基因可能定位于细胞核.qRT-PCR表明,GbWOX9基因的表达量在‘新海16’胚胎发育阶段的球形胚>鱼雷胚>心形胚>胚性愈伤.[结论]根据相对表达量数值估算,GbWOX9在球形胚的表达量是鱼雷胚的1.3倍,是心形胚的3.1倍,是胚性愈伤的5.2倍.故该基因在‘新海16’体细胞胚阶段的球形胚中表达量最高.
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