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肺癌中Hsa-miR-98靶基因生物信息学分析

Bioinformatics analysis of Hsa-miR-98 target gene in lung cancer

摘要[目的]分析肺鳞癌中Hsa-miR-98的靶基因及参与的生物学过程和信号通路.[方法]分析TCGA中收录的肺鳞癌患者的Hsa-miR-98及生存数据,通过4个靶基因数据库和表达数据分析Hsa-miR-98靶基因,利用BiNGO富集分析靶基因功能,通过DAVID数据库富集分析靶基因信号通路.[结果]高表达Hsa-miR-98延长肺鳞癌患者总生存率和无复发生存率.综合4个数据库分析结果,得到Hsa-miR-98的113个靶基因,其中82个在肺鳞癌患者癌与癌旁差异表达.GO分析表明4个基因参与细胞胶原的组成,59个基因参与细胞的生命活动,KEGG通路富集到7条通路,包括肿瘤发生发展、阿米巴运动、胞外基质的形成等.[结论]82个Hsa-miR-98靶基因通过7条信号通路,影响细胞生命活动,进而调控肿瘤发生发展,使高表达Hsa-miR-98患者生存期延长.

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作者 杨毅 [1] 王兆松 [1] 牛瑞芳 [1] 学术成果认领
作者单位 天津医科大学肿瘤医院,天津市肿瘤研究所公共实验室,国家肿瘤临床医学研究中心,天津市肿瘤防治重点实验室,天津市恶性肿瘤临床医学研究中心,天津300060 [1]
分类号 Q811.4
栏目名称
DOI 10.16519/j.cnki.1004-311x.2017.04.0058
发布时间 2017-10-10(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
基金项目
国家自然科学基金项目(“Anxa2介导IL-6诱导的SHP2/Erk和JAK2/STAT3信号通路激活并促进乳腺癌细胞上皮间质转化的分子机制研究”,81372844)
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生物技术

生物技术

2017年27卷4期

355-363页

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