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两种鲤鱼胰凝乳蛋白酶原基因的电子克隆及分析

Cloning and Analysis of Two Common Carp Chymotrypsinogen Genes in silico

摘要为研究胰凝乳蛋白酶原在鱼类中的生理功能和作用机制,利用生物信息学的方法,成功获得了鲤鱼两种胰凝乳蛋白酶原的cDNA序列(ccCHTR1和ccCHTR2)并对其进行序列分析.结果显示,ccCHTR1 cDNA含有792 bp的开放阅读框.编码263个氨基酸;ccCHTR2 cDNA舍有798 bp的开放阅读框,编码265个氨基酸.二者氨基端均舍有18个氨基酸组成的信号肽,同时,在成熟肽的第15和16个氨基酸(R-I)之间存在一个切割位点.氨基酸比对结果显示,ccCHTR1和ccCHTR2具备胰凝乳蛋白酶原的保守结构特征,同时二者有72.8%的同源性,且都与斑马鱼有最高的同源性,分别是93.3%和73.5%.进化分析显示,二者分别与斑马鱼和鳕鱼亲缘关系最近,与哺乳动物的亲缘关系较远.

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生物技术通报

生物技术通报

2011年1期

124-129,133页

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