换一批
换一批低深度测序在检测单细胞染色体微小变异中的应用探索
Application of Low-coverage Whole Genome Sequencing in Detecting Chromosome Micro Variations of Single Cell
摘要旨在探讨低深度测序在检测单细胞染色体微小变异中的应用。以经过比较基因组杂交（arrayCGH，aCGH）检测的5例阳性细胞系为研究对象，从中分离的单细胞分别用两种单细胞扩增试剂盒进行扩增，采用Hiseq2000测序平台进行全基因组测序，然后进行生物信息学分析，将检测结果与已被 aCGH 证实的结果进行比较。结果显示，5个单细胞的全基因组扩增成功，通过低深度测序均获得明确的检测结果。在用 GenomePlex?SingleCellWGAKit 试剂盒的处理中检出区域与 aCGH 检测区域均有80%以上的重叠，1个样本检出了8Mb（Megabase）左右的假阳性；在用 PicoPLEX?WGAKit 试剂盒处理时检出信号与 aCGH 区域也有80%以上的重叠且无假阳性信号产生。证实在数据量为0.1X 左右时可以检出单细胞染色体上7Mb 以上的拷贝数变异。
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主题词
染色体(Chromosomes)指示剂和试剂(Indicators and Reagents)基因组(Genome)比较基因组杂交(Comparative Genomic Hybridization)细胞系(Cell Line)
栏目名称
技术与方法
DOI
10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2016.12.011
发布时间
2016-12-20
基金项目
深圳市未来产业专项资金
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