全基因组小麦PPR基因家族鉴定及表达分析
Genome-wide Bioinformatics Identification of PPR Gene Family and Expression Profiles Analysis in Wheat
摘要旨在筛选对二系杂交小麦杂交种具有育性恢复功能的PPR(Pentatricopeptide repeats)基因,以期进一步研究PPR基因的功能及调控机制.通过对小麦全基因组数据进行生物信息学分析,获得了1351个小麦PPR成员,并对该基因家族进行了染色体定位与分布分析及进化树构建.通过与已报道的水稻育性恢复基因进行同源比对分析,候选了23个育性恢复相关PPR基因.进一步对高、低2种不同类型恢复系、不育系及杂交种减数分裂期幼穗取样,对23个育性恢复相关PPR基因进行实时荧光定量PCR表达模式筛选鉴定.结合结实率等重要农艺性状表型分析发现,4个PPR基因在高恢复系杂交组合中表现出了明显的超亲表达模式,相应地,这4个基因在低恢复系杂交组合中基本呈现低亲的表达模式.初步确认了4个可能参与调控二系杂交小麦杂交种的育性恢复基因.
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