换一批
换一批鸡CEBPA基因CDS区克隆、表达及生物信息学分析
Cloning,Expression and Bioinformatics Analysis of the CDS Region of Chicken CEBPA Gene
摘要为了研究增强子结合蛋白α(CCAAT/Enhancer Binding Protein Alpha,CEBPA)的氨基酸序列特征,以及其编码基因在固始鸡不同组织中的mRNA表达谱.采用PCR技术克隆得到CEBPA的CDS序列全长975 bp,可编码氨基酸325个.生物信息学分析结果显示CEBPA不存在跨膜结构和信号肽,蛋白结构主要由无规则卷曲和α-螺旋结构构成,且多分布在细胞核中;蛋白互做网络构建分析表明,该蛋白与主要与TRBs家族、Runx转录因子家族等相互作用;氨基酸序列对比发现,鸡和鹌鹑的亲缘关系较近;鸡CEBPA 5'调控区-2000 bp序列上启动子和CpG岛预测发现,该序列上有13个不同的启动子和一个长度1640 bp的CpG岛;qRT-PCR表明,CEBPA在12周龄固始鸡不同组织中胸肌和腿肌的表达量显著低于其他组织(P<0.05);不同发育时期胸肌中22周龄的表达量显著低于6周龄和55周龄的表达量(P<0.05);且CEBPA在罗斯鸡胸肌的表达量显著高于固始鸡胸肌的表达量(P<0.05).以上结果为进一步深入探讨鸡CEBPA在胸肌的脂质沉积过程中的生物学功能奠定了基础.
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