番茄青枯病抗性相关miRNA的鉴定与表达分析
Identification and Expression Analysis of miRNA Related to Bacterial Wilt Resistance in Tomato
摘要为理解番茄(Solanum lycopersicum)青枯病抗性响应miRNA与靶基因间的调控关系,对抗、感番茄自交系接种青枯菌(Ralstonia solanacearum)前后进行小RNA测序.结果在 8 个样本中共获得 112.76 M高质量数据,检测到 336 个miRNA,包括 193 个新miRNA.其中,31 个差异表达miRNA靶向调节 575 个基因的表达.556 个靶基因被注释到防御反应、植病互作、植物激素信号转导等代谢途径中.启动子除典型的转录起始TATA-box和CAAT-box,及与生物胁迫相关的W-box和TC-rich repeats,还存在激素、光、非生物胁迫、伤等响应元件.RT-qPCR验证发现 6 对miRNA-targets具有正-负、负-正和负-负 3 种番茄青枯病应答模式.这些结果初步揭示miRNA可以通过靶向基因表达响应番茄青枯病.
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