甜瓜CmEPF基因家族的鉴定及表达分析
Identification and Expression Analysis of Epidermal Patterning Factor(EPF)Genes in Cucumis melo
摘要[目的]表皮模式因子(epidermal patterning factor,EPF)是一类植物特有的分泌蛋白,在植物生长发育特别是气孔形态建成过程中发挥着重要作用,旨为揭示甜瓜EPF基因的特性和功能.[方法]对甜瓜CmEPF基因家族进行基因组鉴定,利用生物信息学手段对其基因结构、系统进化以及组织表达特性进行分析.[结果]甜瓜基因组存在 11 个可分为 3 个亚家族的CmEPF成员,它们的基因结构相对保守,含有 1-3 个内含子,且大都分布于甜瓜的叶绿体上;基于系统进化分析将其分为 3 个亚家族.不同器官RT-qPCR分析发现,CmEPFs基因在甜瓜器官中广泛表达,但不同家族成员在不同器官中的表达模式存在差异,其在第二片叶表达量较高,且气孔密度、光合速率和蒸腾速率最高,其表达量与光合参数和气孔密度显著相关.[结论]CmEPFs基因通过影响甜瓜的气孔密度,影响其光合作用,从而调控甜瓜叶片气孔对外界环境的响应.
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