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RNA结构对RNA沉默效率的影响

RNA Silencing Efficiency Affected by RNA Structure

摘要小RNA(small RNA,sRNA)介导的RNA沉默或RNA干扰(RNA silencing or RNA interference,RNAi)是真核生物基因表达调控的保守机制.内源或外源双链RNA(double-stranded RNA,dsRNA)被加工成sRNA,sRNA通过碱基互补配对识别靶标基因mRNA或DNA,通过降解mRNA、抑制翻译或者DNA甲基化在转录后或者转录水平调控基因表达.由于sRNA作用靶标特异性,RNAi技术被广泛地应用于基因功能研究、生物医药、作物分子设计育种以及开发新型农药等领域.自然界中sRNA能够在不同物种间传递并发挥作用,这一现象为RNAi应用技术的开发提供了理论基础.研究发现,dsRNA诱导RNAi的效率受多种因素影响,例如长度、剂量以及施用方式等.在细胞中,RNA结构的复杂性决定了其功能的多样性.本文概述了基于RNAi的作物病害防控技术的原理,包括宿主诱导的基因沉默(host-induced gene silencing,HIGS)技术、喷施诱导的基因沉默(spray-induced gene silencing,SIGS)技术和微生物诱导的基因沉默(microbe-induced gene silencing,MIGS)技术;总结了靶标RNA和sRNA结构影响RNAi效率的实验证据,以期加深对RNA结构影响RNAi效率地理解,为靶标筛选以及dsRNA设计提供经验,为开发高效RNAi技术提供参考;最后归纳了RNA结构检测和预测的代表性方法,为辅助设计高效诱导RNAi的dsRNA提供方法.

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作者 赵建华 [1] 高峰 [1] 刘清艳 [1] 郭惠珊 [1] 学术成果认领
作者单位 中国科学院微生物研究所 植物基因组学国家重点实验室,北京 100101;中国科学院大学 中国科学院生物互作卓越创新中心,北京 100049 [1]
栏目名称
DOI 10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2024-0857
发布时间 2024-11-29(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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