优化sgRNA提高塔宾曲霉基因编辑效率
Improving the Efficiency of Gene Editing by Optimizing sgRNA in Aspergillus tubingensis
摘要[目的]在CRISPR/Cas9基因编辑系统中,sgRNA是重要的基因编辑元件之一,它与Cas9蛋白结合并通过间隔区序列与基因组DNA互补,引导Cas9蛋白对基因组进行精准剪切.为了提高塔宾曲霉的基因编辑效率,对sgRNA进行优化是一项可行的策略.[方法]对sgRNA的启动子和发夹结构进行了优化,并在塔宾曲霉中进行了基因编辑效率的验证.[结果]通过RNP法进行基因编辑时,带有"lock"结构的sgRNA的基因编辑效率比对照组提高了9.37%;sgRNA在进行体内表达时,使用tRNAGly15和tRNAGly17启动子的基因编辑效率分别高出5S rRNA启动子14%-16%;使用tRNAGly15启动子表达带有"lock"结构的sgRNA,能提高白孢率,并使塔宾曲霉的基因编辑效率提高到96%.[结论]"lock"结构和两种tRNAGly15和tRNA Gly17启动子能够提高塔宾曲霉的基因编辑效率.
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