'红阳'猕猴桃TCP基因家族鉴定及其在果实中的表达分析
Identification of the TCP Gene Family in Actinidia chinensis var.Hongyang and Their Expression Analysis in Fruit
摘要[目的]基于全基因组鉴定'红阳'猕猴桃TCP基因(AcTCPs)家族成员,分析各成员的分类进化关系,研究其组织、果实发育过程和激素处理的表达特性,为深入揭示猕猴桃果实中TCP基因的功能奠定基础.[方法]利用生物信息学方法分析'红阳'猕猴桃TCP转录因子的理化性质、基因结构、保守基序、顺式作用元件及物种间共线性关系等.利用转录组数据和RT-qPCR分析'红阳'猕猴桃中AcTCPs在果实不同发育时期、不同组织中和激素处理下的表达模式.[结果]在'红阳'猕猴桃中鉴定出分布于19条染色体上的40个含有完整TCP结构域的AcTCPs基因,分别命名为AcTCP1-AcTCP40.系统发育分析、保守基序和基因结构分析将它们分为PCF(21)、CIN(12)和CYC/TB1(7),且全基因复制或片段复制在'红阳'猕猴桃TCP基因家族的扩展中发挥了重要作用.组织特异性分析表明,6个候选基因在雄花和果实中高表达,果实不同发育时期RT-qRCR结果显示,AcTCP1在果实发育后期高表达,AcTCP11、AcTCP1、AcTCP35、AcTCP10和AcTCP32在果实发育前期高表达,且表达模式与转录组结果一致.对果实进行外源激素处理结果表明,脱落酸(ABA)和乙烯(ET)处理下调了6个候选AcTCPs的表达;赤霉素(GA3)处理初期上调了AcTCP1、AcTCP35和AcTCP32的表达,氯吡苯脲(CPPU)处理初期上调了AcTCP35和AcTCP32的表达,其余AcTCPs的表达均被GA3和CPPU下调.[结论]从'红阳'猕猴桃全基因组中系统鉴定出40个TCP基因,6个候选基因在果实和雄花中高表达.在果实中AcTCP35、AcTCP32、AcTCP1、AcTCP10、AcTCP11和AcTCP20的表达与果实发育密切相关且受到外源激素(ABA、ET、GA3和CPPU)的调控.
更多相关知识
- 浏览4
- 被引1
- 下载0

相似文献
- 中文期刊
- 外文期刊
- 学位论文
- 会议论文


换一批



