换一批蓖麻LEA基因家族的鉴定和铝胁迫响应分析
Identification of LEA Gene Family and Analysis on Its Response to Aluminum Stress in Ricinus communis L.
摘要[目的]从蓖麻全基因组范围内鉴定RcLEA基因家族成员,分析其基因特征和潜在功能,为揭示LEA在调控蓖麻铝胁迫耐受性中的作用奠定基础.[方法]利用生物信息学方法对蓖麻LEA家族基因进行鉴定,并对其理化性质、系统进化关系、基因结构、保守基序、启动子顺式作用元件,以及该家族部分成员在铝胁迫处理后的表达情况进行分析.[结果]从蓖麻基因组中共鉴定到52个LEA家族基因成员,根据系统发育分析,其可分为RcLEA_1、RcLEA_2、RcLEA_3、RcLEA_4、RcLEA_5、RcLEA_6、Rc_DHN和Rc_SMP 8个亚族,分布于10条染色体上;家族成员氨基酸数量在91?406 aa之间;等电点介于4.54?10.29之间;分子量在9 951.42?44 515.78 Da之间;大多数LEA蛋白为亲水性蛋白;基序分析显示不同亚家族之间的motif有很大差异,但在同一亚类中是相似的.基因结构分析显示,多数基因有1个或1个以上的内含子;52个基因启动子区域均存在1种或多种与植物激素和逆境响应相关的顺式作用元件;共线性分析显示,鉴定到8对复制基因.另外,实时荧光定量PCR结果显示,RcLEA基因在铝胁迫处理下,与对照相比基因表达量发生变化,推测该家族基因参与铝胁迫应答.[结论]从蓖麻基因组中共鉴定出52个RcLEA基因,分为8个亚族.对8个亚族部分RcLEA基因进行铝胁迫表达分析,发现大部分基因表达量变化显著,表明这些基因在蓖麻响应铝胁迫中发挥重要作用.
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关键词
蓖麻LEA基因家族生物信息学全基因组鉴定系统进化铝胁迫处理表达分析铝胁迫应答基因Ricinus communisLEA gene familybioinformaticswhole genome identificationsystem evolutionAl(aluminum)stress treatmentexpression analysisresponse gene to Al stress
栏目名称
DOI
10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2024-1255
发布时间
2025-08-07（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
黑龙江省自然科学基金项目（LH2024C036）
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