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基于BSA-seq的番木瓜株高候选基因定位

Gene Mapping of Plant Height in Papaya Based on BSA-seq

摘要[目的]株高是影响番木瓜产量和品质的重要性状之一,定位番木瓜株高的主要候选基因,为番木瓜的矮化育种提供基因资源.[方法]以YY(植株较高)和GM(植株较矮)为亲本构建定位群体,利用BSA-seq技术对两亲本以及子代混池GY-H(高池)和GY-S(矮池)进行测序分析,数据经质控后,利用ED以及SNP-index法计算混池之间的基因频率差距,定位番木瓜株高候选区间.[结果]本次BSA-seq产生的数据良好,数据经过滤后,最终得到高质量的SNP位点337 980个用于基因定位,利用ED以及SNP-index法计算寻找混池之间基因型频率的显著差异,最终分别在第3、6和8染色体上共定位到大小为0.93 Mb的候选区间,将该区间与番木瓜'紫晖'参考基因组比对,0.93 Mb的区间内共包含46个编码基因,其中,有37个基因被注释.[结论]Cp_zihui12764、Cp_zihui06963、Cp_zihui07024和Cp_zihui12732可能是调控番木瓜株高的候选基因.

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2025年41卷9期

54-61页

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