基于BSA-seq的高粱开花时间基因定位及候选基因预测
Gene Mapping of Sorghum Flowering Time and Prediction of Candidate Genes Based on BSA-seq
摘要[目的]开花时间作为高粱品种选育过程中的关键目标性状之一,对其生态适应性和高产潜力具有重要影响.[方法]以晚开花品种红缨子与早开花品种SAP001杂交构建的F2群体为材料进行开花时间遗传定位分析.[结果]表型调查显示,F2群体中晚花和早花单株的分离比符合3∶1(χ2=0.225,P>0.05),表明该性状受到一对主效基因的控制.通过对极端早花和晚花株系的BSA-Seq分析,在第3染色体59.73?60.44 Mb区间检测到一个与开花时间显著关联的遗传位点.结合双亲重测序和转录组数据,鉴定到一个编码光系统Ⅱ叶绿素结合蛋白的关键候选基因(SbiHYZ.03G218800).该基因启动子区存在Myb/SANT、TATA结合蛋白(TBP)结合位点突变,在亲本间表达差异显著,可能为高粱中调控开花时间的新基因.基于该候选区段中的SNP和InDel变异,开发了一个可有效区分早花与晚花植株连锁分子标记.[结论]揭示了中国酒用高粱开花时间的遗传基础,为开展高粱生育期分子育种提供了重要基因资源和分子标记.
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