换一批果蝇非经典剪接位点的生物信息学预测
Bioinformatics Prediction of Non-Canonical Splice Sites in Drosophila melanogaster
摘要目的:计算识别果蝇中新的非经典剪接位点,以探索未知的剪接机制.方法:基于黑腹果蝇表达序列标签(EST)与其基因组序列比对数据重构基因结构,从中发现非经典的剪接位点,并采用Weblogo软件分析非经典剪接位点上下游序列,以期发现剪接相关的特异性元件.结果:共得到265个非经典的剪接位点,这些剪接位点落在195个蛋白编码基因上.结论:应用生物信息学方法在果蝇中发现了上百个非经典剪接位点,为研究非经典剪接机制奠定了基础.
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主题词
计算生物学(Computational Biology)黑腹果蝇(Drosophila melanogaster)序列比对(Sequence Alignment)预测(Forecasting)方法(Methods)
分类号
Q811.4
DOI
10.3969/j.issn.1009-0002.2010.06.003
发布时间
2010-12-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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