换一批MSAP荧光检测初始数据的自动分析研究
Automatic Processing of the Initial Data of Methylation Level Detect-ed by Fluorescently Labeled MSAP
摘要目的：建立能够实现甲基化敏感扩增多态性（MSAP）荧光检测初始数据自动分析的方法。方法：以17周龄的北京油鸡为实验材料，应用荧光标记的MSAP方法对肌肉组织基因组DNA甲基化水平进行检测，对获得的MSAP荧光检测初始数据通过直接取整法、整区间放置法和半区间放置法等3种计算机处理方法进行分析和比较。结果：对于MSAP荧光检测初始数据的自动转换，半区间放置法与标准的人工转换方法最接近（P>0.05），整区间放置法次之（P>0.05），而直接取整法与标准的人工转换方法差异最大，达到显著水平（P<0.05）。结论：整区间放置法和半区间放置法适用于MSAP荧光检测初始数据的自动分析，建立了基于半区间放置法的在线自动分析软件MSAP Analyst，可实现MSAP荧光检测初始数据的自动分析。
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关键词
甲基化甲基化敏感扩增多态性自动分析荧光检测北京油鸡methylationmethylation sensitive amplified polymorphismautomatic processingfluorescent detec-tionBeijing You chicken
栏目名称
DOI
10.3969/j.issn.1009-0002.2014.04.018
发布时间
2014-09-06（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
国家自然科学基金（31101711）
:北京交通大学创新训练计划
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