换一批
换一批难提取细菌基因组DNA提取方法的比较与优化
Comparison and Optimization of Methods for Extraction of Problematic Bacteria Genomic DNA
摘要目的:比较并优化2种试剂盒提取以巨型球菌为代表的难提取细菌基因组DNA的方法,以获得高质量的DNA用于高通量测序,探索高通量测序样品的前期处理方法.方法:用Life Technologies公司的ChargeSwitch gDNA Mini Bacteria Kit和Roche公司的High Pure PCR Template Preparation Kit提取制备困难的巨型球菌基因组DNA,然后通过添加溶葡球菌酶和增加溶菌酶、RNase A、Protein K的投入量及延长消化时间优化2个试剂盒,对4种方法提取的细菌基因组DNA进行浓度、纯度和基因组完整性测定,选取质量良好的基因组进行高通量测序.结果:改良后的2个试剂盒提取的巨型球菌DNA浓度较高,分别达到78.4和67.8 ng/μL,可满足高通量测序的需求,并获得基因组全序列.结论:改良后的2种方法是提取制备困难的巨型球菌基因组DNA更好的方法.
更多相关知识
分类号
Q78
栏目名称
技术方法
DOI
10.3969/j.issn.1009-0002.2016.03.025
发布时间
2016-07-21
基金项目
“艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治”科技重大专项“十二五”实施计划
国家高技术研究发展计划
国家自然科学基金
- 浏览113
- 被引2
- 下载8
相似文献
- 中文期刊
- 外文期刊
- 学位论文
- 会议论文
