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Vasorin蛋白特异单链DNA适配体的筛选与鉴定

Selection and Identification of ssDNA Aptamers Specific to Vasorin Protein

摘要目的:筛选能特异识别vasorin (VASN)蛋白的单链DNA(ssDNA)适配体并对其进行鉴定.方法:利用SPRSELEX技术筛选VASN蛋白特异ssDNA适配体,通过基因克隆测序、MEME在线软件和RNA structure软件分析富集文库序列并挑选出候选适配体序列,利用EMSA、ELISA、流式细胞术对候选适配体进行特异性与亲和力鉴定.结果:经过5轮SELEX筛选,获得了与VASN蛋白特异结合的ssDNA适配体富集文库,合成候选适配体,经EMSA和ELISA检测分析,证实适配体V4-2能与VASN蛋白特异结合,而不与无关对照牛血清白蛋白结合,其平衡解离常数为281.3±103.7 nmol/L;流式细胞术证实V4-2能够特异识别高表达VASN蛋白的HepG2细胞.结论:筛选获得特异识别VASN蛋白的ssDNA适配体V4-2.

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