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首页 > 生物数学学报 > 基于动态规划的快速序列比对算法

基于动态规划的快速序列比对算法

Fast Sequence Alignment Algorithm Based on Dynamic Programming

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 学术成果认领
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摘要序列比对算法是生物信息学中重要的研究方向之一,而动态规划法是序列比对算法中最有效最基本的方法.由于原有的基本动态规划方法时间和空间复杂度大,不适合实际的生物序列比对,因此本文在分析介绍几种相关动态规划算法的基础上,提出了一种基于动态规划的快速序列比对算法UKK_FA.实验结果表明,该算法有效地降低了时间复杂度,具有一定的实用性.

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作者 唐玉荣 [1] 汪懋华 [2] 学术成果认领
作者单位 中国农业大学,生物学院,北京,100094 [1] 中国农业大学,现代精细农业系统集成研究教育部重点实验室,北京,100083 [2]
关键词 算法序列比对动态规划
医学主题词 算法(Algorithms)序列比对(Sequence Alignment)方法(Methods)时间(Time)计算生物学(Computational Biology)
分类号 TP301.6
DOI 10.3969/j.issn.1001-9626.2005.02.015
发布时间 2005-07-21（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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生物数学学报

生物数学学报

2005年20卷2期

207-212页

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