换一批摘要多序列比对是生物信息学中基础而又重要的序列分析方法.本文提出一种新的多序列比对算法,该算法综合了渐进比对方法和迭代策略,采用加权函数以调整序列的有偏分布,用neighbor-joining方法构建指导树以确定渐进比对的顺序.通过对BAlibASE中142组蛋白质序列比对的测试,验证了本算法的有效性.与Multalin算法比较的结果表明,本算法能有效地提高分歧较大序列的比对准确率.
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关键词
生物信息学多序列比对渐进比对算法迭代策略准确率BioinformaticsMultiple sequence alignmentProgressive alignment algorithmIterative strategyAccuracy
医学主题词
算法(Algorithms)序列比对(Sequence Alignment)计算生物学(Computational Biology)方法(Methods)序列分析(Sequence Analysis)
DOI
10.3969/j.issn.1001-9626.2005.03.004
发布时间
2005-10-20（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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