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首页 > 生物物理学报 > 蛋白质组研究中离子阱串联质谱数据搜库结果解释方法

蛋白质组研究中离子阱串联质谱数据搜库结果解释方法

INTERPRETATION OF DATABASE SEARCH RESULTS OF ION TRAP TANDAM MASS SPECTROMETRY

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摘要基于离子阱串联质谱仪的鸟枪法是一种高通量的蛋白质鉴定方法.得到的数据一般使用软件SE-QUEST搜索蛋白质序列数据库,得到肽段鉴定列表以及相应的打分.为了得到蛋白质鉴定列表,还需要进行肽段鉴定结果的过滤和假阳性率的计算,然后根据肽段鉴定结果组装蛋白质列表.这两个问题目前还没有很好地解决.对已有的方法进行总结和比较,可以给搜库结果解释方法的选择提供参考,对数据质量控制方法的改进也有所帮助.

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作者 张纪阳 [1] 朱云平 [2] 谢红卫 [1] 贺福初 [2] 学术成果认领
作者单位 国防科学技术大学机电工程与自动化学院,长沙,410073 [1] 军事医学科学院放射与辐射医学研究所,北京,100850;北京蛋白质组研究中心,北京,102206 [2]
关键词 SEQUEST离子阱串联质谱数据质量控制蛋白质鉴定
医学主题词 离子(Ions)方法(Methods)蛋白(Egg White)质量控制(Quality Control)蛋白质组(Proteome)
分类号 Q5（生物化学）
栏目名称
综述
DOI 10.3321/j.issn:1000-6737.2006.04.002
发布时间 2006-10-23（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
国家自然科学基金（30070640）
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